AP09258993 Қазақстанда жабайы құстар арасында айналатын А тұмауы вирустарының молекулалық эволюциясы және экологиясы және жаңа кіші түрін анықтау
Жарияланған күні: 08.09.2021 08:58
Ағымдағы жағдай. Тұмау вирусының құрылымын, оның генетикалық өзгергіштігін, гендердің экспрессиясы мен репликациясының әдістерін және иесінің иммундық жүйесімен өзара әрекеттесуін зерттеудегі жетістіктерге қарамастан, тұмау вирусының эволюциясының көптеген мәселелері, соның ішінде вирустардың эпидемиялық және эпизоотиялық нұсқаларының пайда болу механизмдері мен тұрақтылығы шешілмеген күйінде қалып отыр. Оларды ашу үшін әлемнің әртүрлі аймақтарындағы жабайы құстар арасында айналатын А тұмауы вирусының изоляттарына салыстырмалы вирусологиялық және молекулалық биологиялық зерттеулер қажет.
Мәселе бар. Қазақстанның негізгі көші-қон арналарында және әртүрлі экожүйелерінде жабайы құстардан биологиялық материалдарды жинау, молекулалық скрининг және А тұмауы вирустарының штаммдарын оқшаулау, толық геномдық севенирлеу, сондай-ақ үлгілер геномының кітапханасын құру, хосттар шеңберін анықтайтын молекулалық маркерлерді талдау, изоляттардың ішкі гендерінің нуклеотидтер тізбегінің әртүрлілігінің вариациясын зерттеу арқылы "метагеномдық секвенирлеу" қажеттілігі бар. реассортация және түраралық берілу дәрежелері.
Жобаны әзірлеудің маңызды алғышарттарының бірі ҚР орнитофаунасында бұрын анықталмаған, ғылым үшін жаңа А тұмауы вирусының кіші түрінің, сондай-ақ эпидемиялық және эпизоотиялық маңыздылығын білдіретін сүтқоректілерге бейімделген жаңа өзекті және патогендік және реассортанттық нұсқалардың айналымы туралы нақты деректер болды.
Соңғы нәтижелер:
- 2021 жылы: зертханада сақталған биопробтар мен ГАА-дан А тұмауы вирустарының жаңа изоляттары бөлініп, олардың антигендік формулалары анықталады; ғылыми конференцияға қатысады.
- 2022 жылы: секвенирлеу әдісімен А тұмауы вирустары геномдарының нуклеотидтік құрамы декодталады, олардың таксономиялық тиесілігі анықталады және олар кодтайтын ақуыздардың аминқышқылдарының тізбегі есептеледі;
- 2023 жылы: құс тұмауы вирусының қазақстандық изоляттарында иелерінің әртүрлі түрлерімен және кіші түрлерімен байланысты ішкі гендік сегменттерде генетикалық әртүрлілік, реассортация және түраралық берілу дәрежесі белгіленеді. Жобаның мақсаты мен міндеттеріне сәйкес Web of Science базасының Science Citation Index Expanded индекстелетін және (немесе) Scopus базасында Citescore бойынша кемінде 35 (отыз бес) процентилі бар рецензияланатын ғылыми басылымдарда кемінде 3 (үш) мақала және (немесе)шолулар жарияланатын болады; немесе Web of Science базасының Science Citation Index Expanded индекстелетін және (немесе) Scopus базасында кемінде 35 (отыз бес) citescore бойынша процентилі және деректер базасына енгізілген кемінде 1 (бір) патенті бар рецензияланатын ғылыми басылымдарда кемінде 2 (екі) мақала және (немесе) шолулар Derwent Innovations Index (Web of Science, Clarivate Analytics), сондай-ақ КОКСОН ұсынған рецензияланатын шетелдік немесе отандық басылымда кемінде 1 (бір) мақала немесе шолу не рецензияланатын ғылыми басылымдарда кемінде 2 (екі) мақала және (немесе) шолулар, Web of Science базасында 1 (бірінші) және (немесе) 2 (екінші) квартилге кіретін және (немесе) Scopus базасында citescore бойынша процентилі кемінде 65 (алпыс бес); не 1 (бірінші) құрамына кіретін рецензияланатын ғылыми басылымда кемінде 1 (бір)мақала немесе шолу Web of Science базасындағы квартиль және (немесе) Scopus базасында кемінде 80 (сексен) CiteScore бойынша процентилі бар.
Тікелей нәтижелердің сипаттамасы. Жабайы құстардың сезімтал түрлері арасында А тұмауы вирустарының әртүрлі кіші түрлерінің таралу дәрежесі белгіленеді; А тұмауы вирусының әлемдік ғылым үшін жаңа кіші түрі сипатталатын болады және оларды ПТР-да анықтау үшін құралдар әзірленетін болады; рецепторларды байланыстыратын және протеолитикалық сайттардың аминқышқылдарының тізбегі анықталатын болады және хосттар шеңберін анықтайтын молекулалық детерминанттардың болуына РВ2 ақуызының құрылымы зерттелетін болады; Иелерінің әртүрлі түрлерімен және кіші түрлерімен байланысты құс тұмауы вирусының қазақстандық изоляттарының ішкі гендік сегменттерінде генетикалық әртүрлілік, реассортация және түраралық берілу дәрежесі белгіленетін болады; эволюциялық ағаштар салынатын болады және қазақстандық құс тұмауы вирустарының филогенезі айқындалатын болады; материал жинаудың географиялық нүктесінде құс тұмауы вирусының гендік пулы көздерінің шығу тегінің кеңдігі сипатталатын болады; Халықаралық базаларда деректер құс тұмауы вирусының жаңа нұсқаларының гендерінің нуклеотидтік тізбегі сақталады; Вакциналық және диагностикалық препараттарды әзірлеу және өндіру үшін құс тұмауы вирусының оңтайлы штамдары таңдалады.
Жоба жетекшісі-Қыдырманов Айдын Исағалиұлы, ветеринария ғылымдарының докторы, Researcher ID: P-8825-2019; Scopus author ID: 6507024441, https://www.scopus.com/authid/detail.uri?authorId=6507024441
Орындаушылар:
Кобей Өміртайұлы Карамендин-ветеринария ғылымдарының кандидаты,
Scopus author ID: 6505628190, https://www.scopus.com/authid/detail.uri?authorId=6505628190
Қасымбеков Ермұхаммет Төребекұлы, ветеринария магистрі, Scopus author ID: 57193008573, https://www.scopus.com/authid/detail.uri?authorId=57193008573
Сүлейменова Сымбат Амангелдіқызы, ORCID 0000-0003-4107-0681
Сабыржан Темірлан Берікұлы, магистрант
Мәселе бар. Қазақстанның негізгі көші-қон арналарында және әртүрлі экожүйелерінде жабайы құстардан биологиялық материалдарды жинау, молекулалық скрининг және А тұмауы вирустарының штаммдарын оқшаулау, толық геномдық севенирлеу, сондай-ақ үлгілер геномының кітапханасын құру, хосттар шеңберін анықтайтын молекулалық маркерлерді талдау, изоляттардың ішкі гендерінің нуклеотидтер тізбегінің әртүрлілігінің вариациясын зерттеу арқылы "метагеномдық секвенирлеу" қажеттілігі бар. реассортация және түраралық берілу дәрежелері.
Жобаны әзірлеудің маңызды алғышарттарының бірі ҚР орнитофаунасында бұрын анықталмаған, ғылым үшін жаңа А тұмауы вирусының кіші түрінің, сондай-ақ эпидемиялық және эпизоотиялық маңыздылығын білдіретін сүтқоректілерге бейімделген жаңа өзекті және патогендік және реассортанттық нұсқалардың айналымы туралы нақты деректер болды.
Соңғы нәтижелер:
- 2021 жылы: зертханада сақталған биопробтар мен ГАА-дан А тұмауы вирустарының жаңа изоляттары бөлініп, олардың антигендік формулалары анықталады; ғылыми конференцияға қатысады.
- 2022 жылы: секвенирлеу әдісімен А тұмауы вирустары геномдарының нуклеотидтік құрамы декодталады, олардың таксономиялық тиесілігі анықталады және олар кодтайтын ақуыздардың аминқышқылдарының тізбегі есептеледі;
- 2023 жылы: құс тұмауы вирусының қазақстандық изоляттарында иелерінің әртүрлі түрлерімен және кіші түрлерімен байланысты ішкі гендік сегменттерде генетикалық әртүрлілік, реассортация және түраралық берілу дәрежесі белгіленеді. Жобаның мақсаты мен міндеттеріне сәйкес Web of Science базасының Science Citation Index Expanded индекстелетін және (немесе) Scopus базасында Citescore бойынша кемінде 35 (отыз бес) процентилі бар рецензияланатын ғылыми басылымдарда кемінде 3 (үш) мақала және (немесе)шолулар жарияланатын болады; немесе Web of Science базасының Science Citation Index Expanded индекстелетін және (немесе) Scopus базасында кемінде 35 (отыз бес) citescore бойынша процентилі және деректер базасына енгізілген кемінде 1 (бір) патенті бар рецензияланатын ғылыми басылымдарда кемінде 2 (екі) мақала және (немесе) шолулар Derwent Innovations Index (Web of Science, Clarivate Analytics), сондай-ақ КОКСОН ұсынған рецензияланатын шетелдік немесе отандық басылымда кемінде 1 (бір) мақала немесе шолу не рецензияланатын ғылыми басылымдарда кемінде 2 (екі) мақала және (немесе) шолулар, Web of Science базасында 1 (бірінші) және (немесе) 2 (екінші) квартилге кіретін және (немесе) Scopus базасында citescore бойынша процентилі кемінде 65 (алпыс бес); не 1 (бірінші) құрамына кіретін рецензияланатын ғылыми басылымда кемінде 1 (бір)мақала немесе шолу Web of Science базасындағы квартиль және (немесе) Scopus базасында кемінде 80 (сексен) CiteScore бойынша процентилі бар.
Тікелей нәтижелердің сипаттамасы. Жабайы құстардың сезімтал түрлері арасында А тұмауы вирустарының әртүрлі кіші түрлерінің таралу дәрежесі белгіленеді; А тұмауы вирусының әлемдік ғылым үшін жаңа кіші түрі сипатталатын болады және оларды ПТР-да анықтау үшін құралдар әзірленетін болады; рецепторларды байланыстыратын және протеолитикалық сайттардың аминқышқылдарының тізбегі анықталатын болады және хосттар шеңберін анықтайтын молекулалық детерминанттардың болуына РВ2 ақуызының құрылымы зерттелетін болады; Иелерінің әртүрлі түрлерімен және кіші түрлерімен байланысты құс тұмауы вирусының қазақстандық изоляттарының ішкі гендік сегменттерінде генетикалық әртүрлілік, реассортация және түраралық берілу дәрежесі белгіленетін болады; эволюциялық ағаштар салынатын болады және қазақстандық құс тұмауы вирустарының филогенезі айқындалатын болады; материал жинаудың географиялық нүктесінде құс тұмауы вирусының гендік пулы көздерінің шығу тегінің кеңдігі сипатталатын болады; Халықаралық базаларда деректер құс тұмауы вирусының жаңа нұсқаларының гендерінің нуклеотидтік тізбегі сақталады; Вакциналық және диагностикалық препараттарды әзірлеу және өндіру үшін құс тұмауы вирусының оңтайлы штамдары таңдалады.
Жоба жетекшісі-Қыдырманов Айдын Исағалиұлы, ветеринария ғылымдарының докторы, Researcher ID: P-8825-2019; Scopus author ID: 6507024441, https://www.scopus.com/authid/detail.uri?authorId=6507024441
Орындаушылар:
Кобей Өміртайұлы Карамендин-ветеринария ғылымдарының кандидаты,
Scopus author ID: 6505628190, https://www.scopus.com/authid/detail.uri?authorId=6505628190
Қасымбеков Ермұхаммет Төребекұлы, ветеринария магистрі, Scopus author ID: 57193008573, https://www.scopus.com/authid/detail.uri?authorId=57193008573
Сүлейменова Сымбат Амангелдіқызы, ORCID 0000-0003-4107-0681
Сабыржан Темірлан Берікұлы, магистрант
